كدر خاطركم من جهتهم وان كان غير منطبق على الواقع ونلتمس من واسع كرمكم ان لا تقطعوا عنا ما نطمئن به على حجتكم والله يحفظكم محمد عبده 8 شعبان 1300 يهدى سيادتكم مزيد السلام ويقبّل أيديكم إبراهيم أفندي على اللقانى والشيخ امين أبو يوسف من اهالى دمياط منفى في الحوادث المصرية والشيخ احمد القباني من أفاضل بيروت والشيخ احمد عباس من نبهائها وأرباب الافكار الحرة وحسن أفندي بيهم وكل من له ميل إلى الحرية وأنتم في حفظ الله - محمد 8 شعبان 1300 » . وتستفاد منهما شدة العلاقة المعنوية بين الأستاذ وتلميذه . بعد رجوع الشيخ إلى مصر كان يشتغل بالتدريس والتأليف وعين قاضيا في موطنه وعضوا في مجلس إدارة الأزهر وذاع صيته وكان يسعى لاصلاح الدين والعقائد وبسببه هاجمه أهل الجمود وقد لقى من الأذى كثيرا وبقي مفتيا حتى ادركه الاجل . أخيرا اشتغل الشيخ محمد عبده بتفسير القرآن والقى دروسا فيه إلى تلاميذه منهم السيد رشيد رضا وهو جمعها والف تفسير « المنار » وللشيخ مدرسة خاصة في تفسيره وهو توفى سنة 1323 ه . من اعماله : 1 - الواردات القلبية . 2 - مقالات في عروة الوثقى . 3 - الاسلام والنصرانية . 4 - حاشية على شرح الدواني على العقائد العضدية . 5 - رسالة التوحيد . 6 - ترجمة رسالة الرد على الدهريين للسيد جمال الدين كما مرّ . 7 - شرح مقامات بديع الزمان الهمداني . 8 - نشر دلائل الاعجاز للجرجاني .